Rusificarea bisericilor
După anexarea Basarabiei de către Imperiul Rus, autoritățile țariste încep integrarea treptată a structurilor bisericești locale în sistemul Bisericii Ortodoxe Ruse. Este creată Eparhia Chișinăului și Hotinului, aflată sub jurisdicția Sinodului de la Sankt Petersburg.
După Unirea Basarabiei cu România, structurile bisericești din provincie sunt integrate în Biserica Ortodoxă Română. În 1925 este constituită oficial Mitropolia Basarabiei, cu sediul la Chișinău.
După ultimatumul sovietic și ocuparea Basarabiei, autoritățile URSS încep subordonarea structurilor bisericești locale Patriarhiei Moscovei. Procesul este întrerupt temporar în 1941, odată cu revenirea administrației române.
După revenirea Armatei Roșii în Basarabia, Mitropolia Basarabiei încetează să mai funcționeze. Clerul român se retrage sau este înlăturat, iar bisericile din RSS Moldovenească sunt integrate în Patriarhia Moscovei.
Cum a fost blocată reactivarea Mitropoliei Basarabiei
În septembrie 1992, o Adunare Eparhială constituită la Chișinău decide reactivarea Mitropoliei Basarabiei, care funcționase până în 1944 în cadrul Patriarhiei Române. În decembrie 1992, Patriarhia Română recunoaște oficial reactivarea acesteia.
În noiembrie 1993, prin Hotărârea Guvernului nr. 719, statul recunoaște exclusiv Mitropolia Moldovei, subordonată Patriarhiei Moscovei, și refuză înregistrarea Mitropoliei Basarabiei.
Mitropolia Basarabiei solicită în repetate rânduri înregistrarea legală. Autoritățile resping cererile, invocând riscul unor conflicte religioase și existența deja a unei structuri ortodoxe recunoscute oficial. Instanțele naționale oferă soluții contradictorii, iar procesul ajunge la Curtea Europeană a Drepturilor Omului.
13 decembrie 2001 – Condamnarea Republicii Moldova la CEDO
În decembrie 2001, în cauza „Mitropolia Basarabiei și alții contra Moldovei”, Curtea Europeană a Drepturilor Omului stabilește că refuzul autorităților de a înregistra Mitropolia Basarabiei a încălcat libertatea religioasă și libertatea de asociere.
La sfârșitul lunii iulie 2002, ca urmare a hotărârii CEDO, autoritățile recunosc oficial personalitatea juridică a Mitropoliei Basarabiei și îi eliberează certificatul de înregistrare.
Guvernul recunoaște pentru o perioadă Mitropolia Moldovei (afiliată Moscovei) drept succesoare a Mitropoliei Basarabiei istorice. Decizia este anulată ulterior de Curtea Supremă de Justiție. Litigiile privind patrimoniul și succesiunea istorică continuă și după înregistrarea Mitropoliei Basarabiei.
